一、管理制度建设
完善的规章制度是实验室正常运行的保障，中心在学校相关制度的基础上，根据本学科的特点，制定了一系列规章制度。涵盖实验室日常运行、实验室开放管理、实验室安全、实验室设备管理、实验室经费使用等方面，从制度上保障了实验教学工作的正常进行。
二、仪器设备管理
良好的仪器设备是实验室运行的基础，中心通过建立完整的仪器设备管理档案，记录仪器的购置、使用、维护、维修等信息，对仪器实行终身管理，并通过网络数据库，使管理者实时了解仪器设备的使用状况。同时，定期对中心仪器运行状况进行检查，发现故障及时处理，提高设备的完好率，确保实验室仪器设备的良好运行。
三、考评机制建立
为提高人员的工作效率，中心建立了有效的考评机制，奖优惩劣。采用年度述职与师生评价相结合的方式，了解中心工作人员的工作情况，对教学效果好的教师，给予一定的物质和精神奖励；对工作量不够、工作不到位、教学效果差的教师，提出整改意见，并要求本人有整改措施，以观后效。做到奖惩分明，营造良好、高效的工作氛围。
四、安全环保措施实施
实验室安全是保证实验教学和科研工作正常进行的前提，中心严格遵守学校制定的实验室安全条例、规范，同时结合自身特点，制定一系列保障实验室安全的措施：每个实验室设置一名安全员，宣传、监督和落实本实验室的各种安全措施；对初次进实验室操作的师生员工和外来人员进行安全教育和培训；在实验室可能发生危险的区域设置警示标志；对于实验教学中可能发生的突发事故，设立专题预案等。
五、运行经费保障
中心经费来源主要依靠学校教务处的实验教学经费拨款、设备处的设备维护经费拨款、学校实验室建设专项经费、学校“985” 、“211”、“双一流”建设经费和学科建设经费，以满足实验教学中心的正常运行。